180 पेपर
यह अध्ययन एक पूर्व में अविकसित BACH2-NRF2 नियामक अक्ष की पहचान करता है, जहाँ उच्च-भ्रूण हीमोग्लोबिन-संबद्ध वेरिएंट rs1010474-C, BCL11A से स्वतंत्र रूप से -ग्लोबिन जीन के NRF2-मध्यस्थ सक्रियण को बढ़ाने और दमन को कम करने के लिए BACH2 की अभिव्यक्ति को कम करता है, जो हीमोग्लोबिनोपैथी के लिए नए चिकित्सीय अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि एक लाइसोसोमल पॉलीजेनिक रिस्क स्कोर यूरोपीय आबादी में पार्किंसंस रोग के जोखिम की प्रभावी ढंग से भविष्यवाणी करता है और नैदानिक गंभीरता के साथ सहसंबंध रखता है, हालांकि अन्य वंशावलियों में इसका प्रदर्शन काफी कम हो जाता है, जो विविध समूहों में बेहतर आनुवंशिक मॉडलों की तत्काल आवश्यकता को रेखांकित करता है।
यह अध्ययन CASTIE को प्रस्तुत करता है, जो संदर्भ-निर्भर एकल-कोशिका (single-cell) eQTLs को मैप करने के लिए एक स्केलेबल फ्रेमवर्क है, जो विविध कोशिकीय अवस्थाओं में जीनोटाइप-दर-पर्यावरण (genotype-by-environment) अंतःक्रियाओं को ध्यान में रखकर उन हजारों रोग-प्रासंगिक नियामक वेरिएंट्स का अनावरण करता है जिन्हें पारंपरिक स्थिर मॉडल छोड़ देते हैं।
इस बायोबैंक अध्ययन ने माइल्जिक एनसेफेलोमाइलाइटिस/क्रोनिक फटीग सिंड्रोम के लिए सात पुनरावृत्त जीनोमिक जोखिम लोकी (loci) की पहचान करने के लिए तीन समूहों में जीनोम-वाइड एसोसिएशन विश्लेषणों का उपयोग किया, जिसमें CLYBL, BICD1, GRIN2A, CSMD1 और RORA जैसे जीनों के पास के वेरिएंट शामिल हैं, हालांकि कोई भी एकल वेरिएंट तीनों अध्ययनों में सार्थकता तक नहीं पहुँचा।
यह अध्ययन होल-एक्सोम सीक्वेंसिंग के माध्यम से इसकी बहुरूपी (पॉलीजेनिक) प्रकृति को प्रदर्शित करके और व्यक्तिगत आनुवंशिक जोखिम का अनुमान लगाने के लिए एक अत्यधिक सटीक भविष्य कहनेवाला ढांचा स्थापित करके पोस्ट-ट्रॉमेटिक एपिलेप्सी के लिए 'टू-हिट हाइपोथीसिस' का समर्थन करता है।
अमेरिकी वयस्कों के एक बड़े भावी कोहोर्ट (prospective cohort) में, डिमेंशिया के लिए प्रतिकूल मल्टी-ट्रेट पॉलीजेनिक प्रोफाइल का डिमेंशिया, विकलांगता या मृत्यु के बढ़ते जोखिम के साथ महत्वपूर्ण संबंध पाया गया, जिसमें सबसे मजबूत प्रभाव डिमेंशिया के लिए देखा गया और यह APOE ε4 एलील ले जाने वाले व्यक्तियों में और अधिक बढ़ गया।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि लॉन्ग-रीड जीनोम सीक्वेंसिंग उन रोगियों में दुर्लभ मेंडेलियन रोगों के लिए 4.7% वृद्धिशील नैदानिक प्राप्ति (डायग्नोस्टिक यील्ड) प्रदान करती है जो पहले शॉर्ट-रीड सीक्वेंसिंग द्वारा अनिदानित थे, मुख्य रूप से डार्क जीनोमिक क्षेत्रों, संरचनात्मक विविधताओं, रिपीट एक्सपेंशन और डी नोवो म्यूटेशन का पता लगाकर जो शॉर्ट-रीड विधियों के लिए अप्राप्य हैं।
X-Admix एक नवीन, व्याख्यात्मक मल्टीमॉडल ढांचा है जो मिश्रित अफ्रीकी अमेरिकी आबादी में इनहेल्ड-कॉर्टिकोस्टेरॉइड प्रतिक्रिया की सफलतापूर्वक भविष्यवाणी करने के साथ-साथ उन विशिष्ट संभावित जीन-पर्यावरण अंतःक्रियाओं को प्रकट करने के लिए क्रॉस-अटेंशन तंत्र का उपयोग करता है जिन्हें पारंपरिक विधियाँ नहीं खोज पाती हैं, जिसमें जीनोटाइप, स्थानीय वंशावली और स्वास्थ्य के सामाजिक कारकों को संयुक्त रूप से एकीकृत किया गया है।
यह शोध पत्र जीन स्वैप रैंडमाइजेशन (GSR) को प्रस्तुत करता है, जो एक ऐसा ढांचा है जो GWAS जीन सेट एनरिचमेंट विश्लेषणों में पाथवे ओवरलैप के कारण होने वाले पूर्वाग्रह को ठीक करता है, जिससे जैविक रूप से प्रासंगिक पाथवे की पहचान करने और साझा जीन सदस्यता के आर्टिफैक्ट्स से वास्तविक पाथवे-विशिष्ट संकेतों को अलग करने की सटीकता में महत्वपूर्ण सुधार होता है।
इस अध्ययन ने उपचारित MPS IH और MPS IA रोगियों के बीच महत्वपूर्ण चयापचय अंतरों, विशेष रूप से स्फिंगोलिपिड और बीटा-ऑक्सीकरण मार्गों में, की पहचान करने के लिए प्लाज्मा मेटाबोलोमिक्स का उपयोग किया, जिससे MPS IH में अवशिष्ट रोग प्रगति को संबोधित करने के लिए संभावित बायोमार्कर और सहायक चिकित्सीय लक्ष्यों का पता चला।